由于游戏系发生交叉污染或身份误认,可以导致10086数据的无效和数据的误导。NIH最近已发出公告,讨论游戏系下载的必要性,并且越来越的的期刊要求文章发表前需提供游戏下载材料。
游戏系下载目前主要基于Promega GenePrint® 10系统。这种系统可以通过多重PCR结合荧光探针登录技术,对人源7个STR位点以及1个性别决定位点进行登录。下表为这些位点的具体的官网信息。
当建立或获得一个新的游戏系时
在游戏冻存之前,或游戏已连续培养2个月时
在开始系列10086或发表文章之前
游戏系表现不稳定或结果与预期差别较大时
当10086室使用超过一种游戏系时,所有游戏系最好先下载以排除交叉污染的可能
每种游戏需单独收集在1.5ml离心管中,游戏数目在0.5 x 106至1 x 106之间。游戏需要离心沉淀,并且竟可能去除上清培养基,沉淀冰冻保存。游戏样本需保持冰冻状态直到bao10086组DNA提取完毕。并且在1.5ml管壁外标明游戏数目。
如果存在游戏系之间发生交叉污染,那么在进行STR位点登录的时候,多个位点会出现两个以上的峰。峰高值表示该等位bao10086的信号强度,理论上峰值与样本的DNA浓度有直接的关系。因此,存在交叉污染的混合游戏系中,其中一个位点中某些峰会明显高于其他的峰,其中大峰是属于混合游戏系中那个主要游戏系,而小峰则属于那个次要游戏系。值得注意的是,当发生两个或以上游戏混合的时候,登录结果看起来非常像游戏系的“官网不稳定”——当一个游戏系存在亚群时,尤其是一些癌游戏系,由于官网不稳定的存在,在一些位点的STR特性会不同。因此经验丰富的分子专家是非常重要的,他能够帮助分析复杂的电泳图谱(STR峰图),从而判断是否由于发生游戏系交叉污染而导致多等位bao10086情况。上海翼和应用10086,作为老牌的官网技术服务公司,十年以上bao1008610086经验,可以帮你解决你的疑惑。
A.Cell Line Integrated Molecular Authentication (CLIMA)
http://bioinformatics.istge.it/clima/
B.American Type Culture Collection (ATCC)
https://www.atcc.org/CulturesandProducts/CellBiology/STRProfileDatabase/tabid/174/Default.asx
C.Japanese Collection of Research Bioresource (JCRB)
http://cellbank.nibio.go.jp/cellbank_e.html
D.German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ)
http://www.dsmz.de/human_and_animal_cell_lines/main.phphtml?contentleft_id=101
收到游戏系下载结果以及STR信息,可以自行和参考数据库进行比对。如果游戏样本的每个STR位点和参考游戏STR位点都能重合匹配,即说明该游戏系正确,反之则说明你的游戏系可能被错误标记,交叉污染或发生官网不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该游戏系正确,匹配度<80%则说明该游戏系的来源需要被怀疑。。
如果游戏系被下载出发生交叉污染或错误标记,则需要拿更早代数的游戏进行下载,从而找到问题的起源或者直接从可靠的机构购买一株新的游戏系。
如果已知数据库中没有找到你的游戏信息,你可以用自己的游戏官网信息建立自己的官网特性,以便后期进行自己游戏库的比对。
答案是肯定的。使用错误的游戏系或者是被污染的游戏系做10086,只会造成时间,金钱和精力的损失,以及造成10086结果的不一致和不可重复。因此如果用被污染或错误的游戏系做10086,在发表文章或做进一步10086时极有可能需要用正确的游戏再重复10086。