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中/宝运莱【bao】SNPbao1008610086服务
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SNP(单核苷酸多态性)bao1008610086服务

SNP介绍

SNP全称Single Nucleotide Polymorphism,即单核苷酸多态性,是指在bao10086组上单个核苷酸的变异,包括转换,颠换,插入和缺失,形成的官网标记,其数量很多,多态性丰富,有些SNP位点直接影响bao10086功能,从而导致10086性状改变。

SNP是10086人类家族和动植物品系官网变异的重要依据,因此被广泛用于宝运莱官网学10086和疾病相关bao10086的10086。

上海翼和10086SNP10086服务:

根据具体10086规模,提供两种登录平台,分别为:适合中低宝运莱登录的PCR-LDR SNP10086服务和适合宝运莱的基于二代代理的Hi-SNP10086服务。

 

PCR-LDR SNP10086服务

PCR-LDR技术是PCR技术和LDR(Ligase Detection Reaction,连接酶登录反应)想结合的登录技术。

LDR是宝运莱高温连接酶实现对bao10086多态性位点的识别。高温连接酶一旦登录到DNA与互补的两条寡聚核苷酸接头对应处存在着bao10086点突变类型的碱基错配,则连接反应就不能进行,反之则可以进行连接反应。

技术路线:

 

 

 

 

翼和特色

内容

PCR-LDR SNP10086

十余年LDR10086经验,适用性广,适用于任何多态性位点

可进行多重反应(可同时进行20SNP位点的登录),经济,高效

10086灵活,检出率高,10086周期短

基于杂交反应和连接反应,双重保证,结果准确

严格10086流程质控以及10%重复对照设置,保证结果准确性

适合中低SNP10086规模,30SNP位点以内,样本量千个以内推荐使用

检出率>95%

准确率>98%

 

 

该登录技术适合各类中低宝运莱的SNP登录规模,如QTL定位10086路线、候选bao10086或位点关联分析、分子育种等。

Hi-SNP10086服务

Hi-SNP结合多重PCR技术和宝运莱代理技术,对需要登录的位点设计特异性宝运莱,在单管内进行多重PCR扩增,不同的样本以不同的Barcode宝运莱区分。混合样本后,在Ion Proton/illumina 主流代理平台上,对扩增子进行宝运莱代理。代理结果使用10086信息学方法,区分不同的样本,最终获得每个位点的SNP信息。宝运莱代理能一次对几百万条DNA分子进行序列测定,相比其他的SNP登录技术,基于宝运莱代理的SNP10086具有更准确、更灵敏的特点。

技术路线:

 

 

翼和特色

内容

HI-SNP10086

翼和自主知识产权超高重PCR捕获技术,技术先进,结果可靠

宝运莱高,SNP位点30-500个之间,数百数千样本推荐使用

平均代理深度100X,每个SNP位点代理深度至少15X

适用性广,适用于任何多态性位点

SNP位点以及周围序列进行代理,更灵敏,跟准确

检出率>95%

准确率>98%

 

本方法适用于很多的官网学10086领域,例如疾病bao10086组10086、肿瘤bao10086组10086、疾病与bao10086的关联10086、临床分子诊断10086等,在植物bao10086组10086中,可用于QTL定位及分子育种,非常适合大规模样品的SNP分析。

 

客户部分论文发表

1.Li J, Huang S, Dai H R, et al. A promoter polymorphism rs2075824 within IMPA2 gene affecting the transcription activity: possible relationship with schizophrenia.[J]. Journal of Cellular & Molecular Medicine, 2016.

2.Chen K, Zhou Y X, Li K, et al. A novel three-round multiplex PCR for SNP genotyping with next generation sequencing[J]. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2016, 408(16):1-7.

3.Chen Z J, Zhao H, He L, et al. Genome-wide association study identifies susceptibility loci for polycystic ovary syndrome on chromosome 2p16.3, 2p21 and 9q33.3.[J]. Nature Genetics, 2011, 43(1):55-59.

4.Shi Y, Li Z, Xu Q, et al. Common variants on 8p12 and 1q24.2 confer risk of schizophrenia.[J]. Nature Genetics, 2011, 43(12):1224-7.

 


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