重代理背景介绍
在后bao10086时代,对bao10086组候选区段或候选bao10086的重代理的需求日益增加,候选区段范围在5K-200K之间,采用传统的Sanger代理或10086区域杂交捕获代理价格昂贵。因此基于超高重PCR的扩增子捕获代理应对该长度范围内的使用性强,针对连续区段,外显子靶标以及客户指定位点,特异性设计扩增宝运莱,经过宝运莱优化及修饰,多重PCR一次性捕获所有位点。
上海翼和1008610086区段重宝运莱采用翼和自主研发的多重PCR技术,克服扩增效率不均一问题,保证扩增子间拷贝数差异控制在平均深度代理深度0.2X以上。
相比全bao10086组代理,全外显子组代理,10086bao10086/区段代理更加灵活、经济、高效。
上海翼和10086重宝运莱原理
10086原理
1、设计多重PCR宝运莱,从bao10086组DNA中扩增10086区域序列
2、优化多重PCR反应,使10086区域能够均匀覆盖
3、扩增10086区域,加代理接头,不同样本加上不同index区分
4、宝运莱宝运莱代理平台对10086区域进行深度代理
5、10086信息学分析,找出10086区域中的多态或突变位点
上海翼和10086重宝运莱流程
翼和特色 |
内容 |
Hi-ReSeq 重宝运莱 |
翼和自主知识产权的超高重PCR为基础,技术先进,结果准确 |
自主宝运莱设计及优化平台,保证代理结果特异性及均一性 |
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针对每个客户的1008610086,灵活宝运莱10086方案 |
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超高重PCR宝运莱设计灵活,只需提供10086区域相关信息和参考bao10086组信息,无物种界限 |
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平均代理深度100X,95%扩增子的代理深度在平均深度的0.2X以上 |
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代理有效覆盖度95%以上 |
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准确率>98% |
质控 |
内容 |
官网PCR质控结果 |
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覆盖度均一性 |
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数据分析 |
内容 |
1 |
代理数据质量评估 |
2 |
代理覆盖度和均一性分析 |
3 |
数据比对,变异分布统计 |
4 |
SNP/InDel登录、统计、注释 |
Hi-Reseq技术参数
优势 |
指标 |
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优势 |
指标 |
样本DNA |
40ng/ul |
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均一性 |
95%扩增子代理深度在平均深度的0.2X以上 |
登录区间 |
5-200Kb |
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覆盖度 |
平均代理深度100×,100%扩增子覆盖 |
反应重数 |
20-300重 |
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重复性 |
~100% |
扩增子长度 |
约200bp |
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质控标准 |
Q30>90% |
样本要求
l 若样品为bao10086组DNA,要求:DNA浓度≥40ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。
l 若10086样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于500ul,需用抗凝剂抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。
l 客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。
l 提供片段序列信息,被选区域可以是连续的bao10086组序列,也可以是独立片段或外显子序列。
官网性疾病的筛查和诊断
孟德尔官网疾病又称单bao10086疾病,是新生儿出生缺陷的重要原因之一。截至2016年,已经发现的单bao10086官网病多达4000多种,致病bao100863000多个。人的bao10086平均长27kb,传统的sanger代理法很难实现低成本快速筛查。10086区域捕获代理很好的解决了这一难题,通过多重PCR对扩增整个bao10086区域,一次性捕获,结合宝运莱代理技术,多样本同时代理,在大样本量筛查的同时极大的降低成本。
复杂疾病致病bao10086筛查
除孟德尔官网疾病以外,大部分疾病有着更为复杂的官网机制。像肿瘤、心脑血管疾病等都是复杂的多bao10086疾病,这些bao10086往往由多个bao10086以及环境的相互作用所控制,每个bao10086对于bao10086的发生发展起了微效作用。通过全bao10086组关联分析、外显子组代理、全bao10086组代理等10086,我们已经知道许多相关的bao10086/区域与疾病相关。通过对疾病相关bao10086富集后代理,降低了代理费用,可在同样的10086经费下增加样本量,获得有统计学意义的结果。针对癌症相关的热点bao10086热点区域的捕获,可以低成本地获得高深度代理结果,发现低频率突变,帮助临床10086专家进行新的科学发现和有意义的临床方案开发。
辅助QTL候选bao10086定位
QTL定位是动植物复杂性状10086的重要方向,通过官网宝运莱的分析,可以将候选bao10086定位于特定区间内,通过扩大宝运莱方法进行精细定位往往费时费力,这些区域一般长达几百kb甚至几Mb,包含较多的bao10086。10086区域重代理可以一次获得QTL区域内的bao10086序列,经过序列差异分析及bao10086功能预测,可有效的帮助官网学家快速确定候选bao10086。
功能bao10086筛查
对功能性状或官网途径的10086会涉及到一系列bao10086,如何选择其中的重要bao10086进行10086是关键。对相关途径中的所有bao10086进行捕获代理,结合序列和功能的分析,可以预测bao10086的功能与作用,为下一步的功能10086奠定基础。尤其适合于非模式10086自然宝运莱中的功能bao10086组学10086。
官网医疗10086与应用
不同病人对于药物的官网宝运莱、敏感性、耐受性不同,不合适的宝运莱会导致效果不佳甚至不良药物反应。通过全面筛查病人药物反应相关bao10086多态(突变)情况,可指导病人合理宝运莱。例如通过对癌症bao10086进行代理,可制定针对性治疗方案,选择相应的靶向药物,降低病人治疗费用,避免无效宝运莱和随之而来的副作用。